Друга світова війна і далі
Наростаюча напруга між словацькою та чеською більшістю та значною німецькою меншиною в країні досягла піку, коли протягом 1938 року Гітлер наказав самовизначення німецькомовного народу Чехословаччини. Щоб заспокоїти Гітлера, Франція та Великобританія відмовилися від прикордонних територій країни. У березні 1939 року, переконавши словацьких націоналістів вийти і створити майже фашистську, нібито незалежну «Словацьку державу», Гітлер перетворив решту країни на «Протекторат Богемської Моравії», або Велику Німеччину. Послідували шість довгих років насильницького панування, перш ніж російські війська звільнили місто в травні 1945 року.
На парламентських виборах 1946 року Комуністична партія отримала майже 40% голосів. Едвард Бенеш, довоєнний некомуністичний президент, був знову обраний і попросив лідера комуністів-ветерана Клемента Готвальда скласти коаліційний уряд. У 1948 році багато некомуністичних політиків пішли у відставку на знак протесту проти його політики. У цей момент Готвальд наповнив уряд своїми прихильниками. Після того, як Ян Масарик (син Томаша), улюблений некомуністичний міністр закордонних справ, був виявлений мертвим під вікном його офісу в міністерстві закордонних справ, поширилися чутки, що він став жертвою дефенестрації.
Як новий правитель, Готвальд окреслив 5-річну економічну програму, придушив духовенство і ліквідував своїх супротивників як всередині, так і поза його партією; багато було вбито, а тисячі заарештовані. Показові випробування проводилися під керівництвом Антоніна Новотного, а фермерів зіштовхували в колективи.
«Празька весна» 1968 року була недовгою. Це була спроба комуністів-реформаторів на чолі зі словаком Олександром Дубчеком змінити систему та створити соціалістичну державу «з людським обличчям». Це не вдалося і було зірвано радянськими танками, які бунтували по країні протягом усього серпня. Протягом наступних 2 десятиліть при владі перебували відновлені жорсткі комуністи, які підкупили населення, заповнюючи полиці магазинів споживчими товарами, хоча й низької якості. Кілька дисидентів, що залишилися, серед них драматург Вацлав Гавел , зазнали рутинних переслідувань і переслідувань.