Otrais pasaules karš un tālāk
Krājošā spriedze starp slovāku un čehu vairākumu un valsts ievērojamo vācu minoritāti sasniedza maksimumu, kad 1938. gadā Hitlers pavēlēja Čehoslovākijas vāciski runājošajiem iedzīvotājiem pašnoteikšanos. Lai nomierinātu Hitleru, Francija un Lielbritānija atteicās no valsts pierobežas. 1939. gada martā pēc slovāku nacionālistu pārliecināšanas izstāties un izveidot gandrīz fašistisku, šķietami neatkarīgu “Slovākijas valsti”, Hitlers pārveidoja pārējo valsti par “Bohēmijas Morāvijas protektorātu” jeb Lielvāciju. Sešus ilgus gadus ilga vardarbīga valdīšana, pirms Krievijas karaspēks 1945. gada maijā atbrīvoja pilsētu.
1946. gada parlamenta vēlēšanās Komunistiskā partija ieguva gandrīz 40% balsu. Atkal tika ievēlēts pirmskara nekomunistiskais prezidents Edvards Benešs, kurš lūdza komunistu veterānu līderi Klementu Gotvaldu izveidot koalīcijas valdību. 1948. gadā daudzi nekomunistu politiķi atkāpās no amata, protestējot pret viņa politiku. Šajā brīdī Gotvalds piepildīja valdību ar saviem atbalstītājiem. Pēc tam, kad Jans Masaryks (Tomaša dēls), iecienītais ārlietu ministrs, kas nav komunists, tika atklāts miris zem sava biroja loga Ārlietu ministrijā, klīda baumas, ka viņš ir bijis aizstāvēšanās upuris.
Būdams jaunais valdnieks, Gotvalds izklāstīja 5 gadu ekonomisko programmu, apspieda garīdzniecību un likvidēja savus pretiniekus gan savas partijas iekšienē, gan ārpus tās; daudzi tika nogalināti, un 1000 tika arestēti. Paraugpārbaudes tika veiktas Antonīna Novotnija vadībā, kamēr lauksaimnieki tika iestumti kolektīvos.
1968. gada “Prāgas pavasaris” bija īslaicīgs. Tas bija komunistu reformas mēģinājums, ko vadīja Aleksandrs Dubčeks (slovāks), mainīt sistēmu un izveidot sociālistisku valsti “ar cilvēcisku seju”. Tas neizdevās, un to izjauca padomju tanki, kas visu augustu skrēja pār valsti. Nākamo 2 gadu desmitu laikā pie varas bija atjaunoti stingrās līnijas komunisti, kas piekukuļoja iedzīvotājus, iepakojot veikalu plauktus ar patēriņa precēm, kaut arī zemas kvalitātes. Daži atlikušie disidenti, tostarp dramaturgs Vāclavs Havels , tika regulāri vajāti un vajāti.