Kedatangan Habsburg
Bohemia diperintah oleh raja-raja yang tidak hadir setelah kematian George sampai tahun 1526 ketika Habsburg mengklaim takhta. Dinasti Katolik yang kuat ini memerintah atas sisa-sisa Kekaisaran Suci Roma dan memusatkan upaya mereka untuk menjaga perbatasan mereka dengan Eropa dari ancaman signifikan dari Utsmaniyah. Pada saat ini, agama Protestan telah berkembang menjadi pengaruh yang kuat, dan faksi-faksi agama yang serius di Bohemia hanyalah masalah lain yang harus mereka hadapi.
Kaisar Rudolph yang Kedua naik takhta pada tahun 1576 dan mengubah ibu kota menjadi Praha (dari Wina). Sponsor kekaisaran membawa ilmu pengetahuan dan seni ke tingkat yang lebih tinggi, dan bangunan Renaisans yang mengesankan menambah kemegahan kota. Pencapaian utama Rudolph adalah undang-undang yang mengizinkan kebebasan berekspresi beragama baik bagi Protestan maupun Katolik. Meskipun demikian, undang-undang ini tidak dilanjutkan oleh Ferdinand the Second, raja Katolik yang naik takhta pada tahun 1611, dan pertengkaran agama yang membara segera memuncak.
Defenestrasi 1618 memicu Perang 30 Tahun yang naas. Frederick dari Palatinate, seorang raja baru, terpilih. Namun, selama 1620, pasukan Protestannya digulingkan oleh pasukan kekaisaran di sebuah bukit rendah di luar Praha. ‘Pertempuran Gunung Putih’ ini dianggap sebagai salah satu hari terburuk dalam sejarah negara itu. Dampaknya dirusak oleh eksekusi publik terhadap orang-orang Protestan terkemuka dan pengusiran, dari Praha, terhadap siapa saja yang menolak menjadi seorang Katolik.
Kemenangan menentukan Ferdinand secara dramatis mengubah keadaan Praha yang sekarang lelah. Sejarawan berikutnya menggambarkan periode berikutnya sebagai ‘Kegelapan’, sebuah era ketika orang-orang Ceko menjadi mayoritas tertindas di negara mereka sendiri: Penguasa mereka dibunuh atau diusir, bahasa mereka dipinggirkan, dan agama pilihan mereka dilarang. Ini sebagian besar benar. Perkebunan Protestan yang disita dijual dengan harga lebih murah kepada para pendukung Habsburg, yang sebagian besar adalah orang asing (terutama orang Jerman). Bahasa Jerman diadopsi sebagai bahasa masyarakat yang sopan, dan, akhirnya, bahasa Ceko hanya digunakan oleh kaum miskin kota dan petani. Kelompok agama lain, seperti Yesuit, mencoba membasmi sisa-sisa terakhir Protestantisme. Tapi, itu tidak semua malapetaka dan kesuraman. Setelah negara itu keluar dari konflik bertahun-tahun, ledakan konstruksi mengubah pedesaan dan kota-kota dengan keajaiban arsitektur dan seni Barok. Meskipun demikian, ketegangan antara warga Praha yang berbahasa Ceko dan warga yang berbahasa Jerman akan tetap ada hingga abad kedua puluh dan memiliki konsekuensi yang luas.
Pertahanan Kedua Praha
Terperangkap di dalam Kastil Praha dengan musuh-musuh Protestan mereka yang pendendam pada tanggal 23 Mei 1618 , 2 pejabat kekaisaran yang ketakutan berteriak minta ampun, tetapi tangisan mereka tidak didengar. Dipaksa ke jendela dengan sekretaris sial mereka, mereka didorong keluar, meskipun salah satu dari mereka mati-matian menempel di ambang jendela sampai dia dibundel oleh pukulan cepat dari pisau. Jatuhnya mereka ke dalam parit jauh di bawah seharusnya sudah cukup untuk membunuh mereka; Namun, mereka selamat dan berhasil melarikan diri dengan takjub semua orang. Catatan Katolik tentang insiden tersebut menyatakan bahwa kejatuhan mereka dipecahkan secara ajaib oleh Perawan Maria. Catatan Protestan, dan mungkin lebih dapat dipercaya, menyatakan bahwa sejumlah besar sampah yang menumpuk di parit telah merusak kejatuhan mereka.
Bangsa Bangkit di Abad Kedua Puluh
Selama abad kedelapan belas, pemerintahan Habsburg mulai menjadi lebih liberal, terutama selama pemerintahan Kaisar Joseph yang Kedua (1780-90). Reformasi sistem pendidikannya menciptakan generasi Ceko yang melek huruf dan menjadi lebih sadar akan sejarah mereka sebelumnya dan penindasan mereka saat ini. Sepanjang awal abad kesembilan belas, elit intelektual muncul, membawa bahasa Ceko kembali menonjol, mempromosikan ‘literaturnya dan melobi untuk hak-hak Ceko di Kekaisaran. Pada akhir abad itu, Praha, yang Kaisar Franz Josef gambarkan sebelumnya sebagai ‘setiap bagian kota Jerman’, telah sepenuhnya dikuasai oleh orang-orang Ceko; Rambu-rambu jalan Jerman telah hilang, dan gedung-gedung megah, seperti Teater Nasional dan Museum Nasional mencerminkan bangsa Ceko yang semakin percaya diri.
Setelah Archduke Franz Ferdinand, yang merupakan pewaris takhta Habsburg, terbunuh pada Juni 1914, Kekaisaran Hongaria Austro tenggelam dalam Perang Dunia Pertama. Dari sisa-sisa Austria-Hongaria yang ditaklukkan, Republik Ceko yang merdeka dideklarasikan pada Oktober 1918, yang terdiri dari Moravia, Slovakia, dan Bohemia. Tomáš Masaryk, seorang profesor filsafat yang terhormat , adalah presiden awal republik pertama.