Husitterne
Hussitperioden er måske den vigtigste i tjekkisk historie, men den er bestemt den mest spændende. Jan Hus var universitetsprofessor ved Charles University , og han troede stærkt på den engelske teoretiker John Wycliffes ideer. Hus var hovedpersonen i bevægelsen om at have en tro baseret på Bibelen i stedet for kirkens hierarki.
Måske var hans mest radikale overbevisning, at alle kristne skulle have fuld nadver, da det på det tidspunkt kun var medlemmer af gejstligheden, der fik lov til at drikke Kristi blod. Faktisk blev denne del af hans tro så kendt, at kalken, der blev brugt til nadver, kom til at symbolisere hussitterne. Han samledes til kirkereform et helt århundrede før Martin Luther og gik også ind for hans tro på, at aflad ikke skulle være tilgængeligt for folk at købe.
I 1415 blev Hus stævnet til Konstanz for at møde for et kirkeråd. Han blev dømt for kætteri og blev brændt på bål som straf.
Hus’ død stoppede dog ikke hussitterbevægelsen – faktisk opildnede den den endnu mere, og Bøhmen blev hurtigt fuld af religiøse radikale. Dette førte til hussitterkrigene. Disse krige begyndte, da en demonstration i 1419 af hussitter gik ud af kontrol, hvor demonstranterne tvang deres vej ind i Nyt rådhus , inden man så smider adskillige katolske rådsmedlemmer ved at smide dem ud af vinduet – noget, der er en traditionel tjekkisk metode til at slå mennesker ihjel, ser det ud til. Efter at hussitterne så ødelagde nogle af byens områder, begyndte kongen af Bøhmen, Sigismund, mange korstog mod hussitterne, som spredte sig langt uden for Bøhmens grænser. Han blev besejret på Vítkov-bakken gennem hussitternes leder, Jan Žižka – en mand med kun ét øje. Der er et monument af Žižka på det sted, hvor slaget stod på i dag.
Stabilitet blev opnået, da en hussitisk konge blev valgt i 1458, hvor denne mand var kong George af Poděbrady (Jiří z Poděbrad). Adelen, der valgte ham, gjorde det dog ikke med glæde. Da han døde, inviterede de det polske Jagiellon-dynasti til at indtage den bøhmiske trone og forhindrede dermed kongeriget i at falde i hænderne på kættere for længe. Efter at Vladislav II, den polske konge, døde – efter en regeringstid præget af, at hans beføjelser blev begrænset af de bøhmiske adelsmænd, og også at han flyttede hovedstaden til Buda i 1490 – blev han erstattet af Ferdinand af Habsburg, bror til den hellige romerske kejser Karl V. Habsburgerne ville fortsætte med at regere Bøhmen indtil 1918.